本作承接《奥特银河格斗2：巨大阴谋》，讲述奥特英雄们与阿布索留特人之间惊动银河的命运之战。　　同时新的奥特战士——雷古洛思奥特曼和阿布索留特人的战士——迪亚波罗亦将登场。

魔爪伸向了M78星云·光之国！受到了不知是谁的攻击，被铭刻在脉搏上的“新生代奥特曼”的记忆丢失了。接受了“对奥特曼羁绊的挑战”的光之国，又一讯息到来了。那是新的光之道具“次元格斗仪”，上面托付了未来人的信息。为了找回丢失的…

工藤优幸作为民间警备组织E.G.I.S.的一员，有着变身为泰迦、泰塔斯、风真的能力。经过与无数敌人的战斗，工藤优幸和泰迦、泰塔斯、风真之间的羁绊更加深厚。但是，他们却被邪恶势力瞄准。知道这件事后，新生代的奥特曼战士们为了拯救他们…

在父亲经营的小卖店工作的凑活海与大学生的凑勇海两兄弟与妹妹和父亲一同生活在一起，城市中突然出现未知巨大生物，兄弟二人获得了罗布回旋闪光和罗布水晶和奥特力量。前期兄弟俩刚刚得到奥特力量，还不能完全熟悉，因此也产生了很多危机…

被称作奥特黑暗杀手的黑暗魔人，具有创造奥特战士的黑暗战士的能力。赛罗奥特曼和格丽乔奥特曼落入了黑暗杀手之手！为了应对这场危机，泰罗奥特曼召集了“新世代英雄”，银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼、欧布奥特曼、捷德奥特…

绫香市已经有一年多没出现过怪兽了。凑家一家人开始朝着自己的梦想努力奋斗。可是，唯独只有活海还没有想好未来究竟想要干什么。活海有一位高中同学叫户井。当年，户井立志要学游戏制作。他们毕业后就没再见过了，活海打算去找户井叙叙旧…

TV系列的幕后黑手托雷基亚败给了泰迦奥特曼，被封印在托雷基亚体内的邪神魔兽格里姆德借机从托雷基亚体内逃出。托雷基亚设计引来了泰迦的父亲泰罗奥特曼，最终托雷基亚阴谋得逞，还让泰罗坠入了黑暗。恶人协会的人似乎盯上了伊吉斯的优幸…

绫香市已经有一年多没出现过怪兽了。凑家一家人开始朝着自己的梦想努力奋斗。可是，唯独只有活海还没有想好未来究竟想要干什么。活海有一位高中同学叫户井。当年，户井立志要学游戏制作。他们毕业后就没再见过了，活海打算去找户井叙叙旧…